「光明之心」的故事始于某一天，一位神秘少女辉夜在温达利亚岛的海岸上被男主角里克发现，其后更发现她的记忆和感情均已失去，而通过与岛上居民进行心灵交流，辉夜也一点点地取回了感情。与此同时，本身和平的温

野矢一树是转入公立海老栖川高校的新生，对天文感兴趣的他本想申请加入天文部，但却错入部室，成为了原本仅由女生组成的天闷部的一员。在这里，一树遇到了个性鲜明的女生部员们，有常常搞出问题来的户田山响子、天闷